Pileus Git - ~andy/sunrise/blob - sci-biology/clover/clover-2006.07.17.ebuild

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   3 # $Header: $
   4
   5 inherit versionator toolchain-funcs
   6
   7 MY_PV=$(replace_all_version_separators '-')
   8 MY_P="${PN}-${MY_PV}"
   9 DESCRIPTION="Cis-eLement OVERrepresentation: Detection of functional DNA motifs"
  10 HOMEPAGE="http://zlab.bu.edu/clover/"
  11 SRC_URI="http://zlab.bu.edu/~mfrith/downloads/${MY_P}.tar.gz
  12         http://zlab.bu.edu/clover/jaspar2005core"
  13
  14 LICENSE="as-is"
  15 SLOT="0"
  16 IUSE=""
  17 KEYWORDS="~x86"
  18
  19 DEPEND=""
  20 RDEPEND=""
  21
  22 S="${WORKDIR}/${MY_P}"
  23
  24 src_unpack() {
  25         unpack ${MY_P}.tar.gz
  26         sed -i "s:g++:$(tc-getCXX):; s:-Wall -O3:${CFLAGS}:" Makefile || die "sed failed"
  27 }
  28
  29 src_compile() {
  30         emake || die "emake failed"
  31 }
  32
  33 src_install() {
  34         dobin clover
  35         insinto /usr/share/${PN}
  36         doins "${DISTDIR}"/jaspar2005core || die "doins failed"
  37 }
  38
  39 pkg_postinst() {
  40         elog "The motif library jaspar2005core has been installed in"
  41         elog "    /usr/share/clover/jaspar2005core"
  42         elog "You can pass this library to clover for motif search, or use your own library."
  43 }